NC_001344 AY536371 1 CATGCACACCTAAAAGCTTATGCAAAAATTAATGAGGAATCTTTGGATAG 50 |||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||**||||||| 1 CATGCACACCTAAAAGCTTATGCGAAAATTAATGAGGAATCGCTGGATAG 50 51 GGCTAGGAGATTGCTTTGGTGGCATTACAACTGTTTACTGTGGGGAGAAG 100 ||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||| 51 GGCTAGGAGATTGCTTTGGTGGCATTACAATTGTTTACTGTGGGGAGAAG 100 101 CTAACGTTACTAATTACATTTCTCGGCTCCGTACTTGGTTGTCAACTCCG 150 ||||||||||||||||*|||||||||||*|||||||||||||||||*||* 101 CTAACGTTACTAATTATATTTCTCGGCTACGTACTTGGTTGTCAACACCT 150 151 GAAAAGTACCGAGGCCGTGATGCCCCAACCATTGAAGCAATCACTAGACC 200 |||||*||**|||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||| 151 GAAAAATATAGAGGCCGAGATGCCCCAACCATTGAAGCAATCACTAGACC 200 201 AATCCAAGCGGCTCAGGGAGGCAGAAAAACATCTTCGGGAACTAGAAAAC 250 ||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||*| 201 AATCCAAGTGGCTCAGGGAGGCAGAAAAACATCTTCGGGCACTAGAAAGC 250 251 CTCGTGGACTCGAACCTAGAAGAAGAAAAGTTAAAACCACAGTTGTCTAT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 251 CTCGTGGACTCGAACCTAGAAGAAGAAAAGTTAAAACCACAGTTGTCTAT 300 301 GGGAGAAGACGTTCAAAGTCCAGGGAAAGGAGAGCCCCTTCACCCCAACG 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 301 GGGAGAAGACGTTCAAAGTCCAGGGAAAGGAGAGCCCCTTCACCCCAACG 350 351 TGCGGGCTCCCCTCTCCCACGTAGTTCGAGCAGCCACCATAGATCTCCCT 400 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||| 351 TGCGGGCTCCCCTCTCCCACGTAGTTCGAGCAGCCACCGTAGATCTCCCT 400 401 CGCCTAGGAAATAAATTACCTGCTAAGCATCACTTGGGGAAGTTGTCAGG 450 |||||||||||||*|||||||||||*|||||||*|*|||||*|||||||| 401 CGCCTAGGAAATAGATTACCTGCTAGGCATCACCTTGGGAAATTGTCAGG 450 451 TTTATATCAAATGAAGGGTTGTACCTTTAACCCTGAATGGAAAGTACCTG 500 *||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 451 ATTGTATCAAATGAAGGGTTGTACCTTTAACCCTGAATGGAAAGTACCTG 500 501 ATATTTCGGATACTCATTTTGATTTACAAGTAGTAAATGAGTGCCCTTCC 550 |||||||||||||||||||||||*|*||||||*||||||||||||||||| 501 ATATTTCGGATACTCATTTTGATATGCAAGTAATAAATGAGTGCCCTTCC 550 551 CGAAATTGGAAATATTTGACTCCAGCCAAATTTTGGCCCAAGAGCATTTC 600 |||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||| 551 CGAAATTGGAAATATCTGACTCCAGCCAAATTTTGGCCCAAGAGCATTTC 600 601 CTACTTTCCTGTCCAGGCAGGGGTTAAAGCGAAATATCCTGACAACGTGA 650 ||||||||||||*|||||||||||||||||*||*|||||||||||*|||| 601 CTACTTTCCTGTACAGGCAGGGGTTAAAGCTAAGTATCCTGACAATGTGA 650 651 TGCAGCATGAGGCAATAGTAGGTAAATATTTGAACAGGCTCTATGAAGCA 700 ||||||||||**|||||||||||||||||||*|*|||||||||||||||| 651 TGCAGCATGAATCAATAGTAGGTAAATATTTAACCAGGCTCTATGAAGCA 700 701 GGAATCCTTTATAAGCGGATATCTAAACATTTGGTTACATTCAAAGGCAA 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||**| 701 GGAATCCTTTATAAGCGGATATCTAAACATTTGGTTACATTTAAAGGTCA 750 751 GCCTTATAATTGGGAACTTCAATACCTTGTCAAGCAACATCAAGTTCCTG 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 751 GCCTTATAATTGGGAACTTCAATACCTTGTCAAGCAACATCAAGTTCCTG 800 801 ATGGGACAACAACCAGCAAAATCAATGGACGTGCGGAGAATCGAAGGAGG 850 |||||*|||***||||||||||||||||*||||||||||||||||||*|| 801 ATGGGTCAAAGCCCAGCAAAATCAATGGGCGTGCGGAGAATCGAAGGGGG 850 851 AGAGCTCCTGCTAAATCAATTAGCAGGCCGCATGATTCCGAAAGGGACTG 900 |||*|||||||||*|*|||*|||||||||||||||||||||||||||||| 851 AGAACTCCTGCTACAACAACTAGCAGGCCGCATGATTCCGAAAGGGACTG 900 901 TAACATGGTCGGGCAAATTTCCAACAATAGATCATCTATTAGACCATGTG 950 ||||||||||*|||||||||||||||||||||||**|||||||||||||| 901 TAACATGGTCAGGCAAATTTCCAACAATAGATCACGTATTAGACCATGTG 950 951 CAAACAATGGAGGAGGTAAACACTCTTCAACAACAGGGCGCTTGGCCTGC 1000 |||||||||||||||*|||||||*||*|||*|*||*||*||*|||||*|* 951 CAAACAATGGAGGAGATAAACACGCTCCAAAATCAAGGAGCATGGCCGGA 1000 1001 TGGGGCGGGAAGACGATTGGGACTGACCAATCCTACTCCTCACGAGACGC 1050 *|||||||||||**||***||**|*|||||||||*|||||||*||||**| 1001 AGGGGCGGGAAGGAGAGCAGGGTTAACCAATCCTGCTCCTCAAGAGATTC 1050 1051 CTCAGCCTCAGTGGACTCCCGAGGAAGATCAAAAAGCTCGCGAGGCTTTT 1100 |||||||**|||||||*||*||*||||||||||||||||||||||||||| 1051 CTCAGCCCAAGTGGACCCCGGAAGAAGATCAAAAAGCTCGCGAGGCTTTT 1100 1101 CGTCGATATCAAGAAGAAAGGCCACCGGAAACCACCACCATTGCTCCTAC 1150 |||||*||*||*|||||*||*|||||||||||||||*|||||*||||*|| 1101 CGTCGTTACCAGGAAGAGAGACCACCGGAAACCACCGCCATTCCTCCAAC 1150 1151 GTCACCAACTCCGTGGAAGCTACAACCAGGGGACGATCCACTCCTGGAAA 1200 *||*|||||||*||||||*|||||||||||*||||||||||||||||*|| 1151 ATCGCCAACTCAGTGGAAACTACAACCAGGAGACGATCCACTCCTGGGAA 1200 1201 ACAAGTCTTTACTCGAGACTCATCCTCTTTACCAGAATCCCGAGCCAGC- 1249 ||||||||*|*||*|||||*|||||*||||||||||||||*||||||||* 1201 ACAAGTCTCTGCTAGAGACACATCCACTTTACCAGAATCCAGAGCCAGCA 1250 1250 --CGTGCCTGTGATAAAGACTCCTCCCCTCAAGAAGAAGAAAATGCCTGG 1297 **||||||||||||||||||||||||*|||||||||||***||||*|||| 1251 GCCGTGCCTGTGATAAAGACTCCTCCGCTCAAGAAGAA---AATGTCTGG 1297 1298 TACCTTCGGGGGAATACTAGCTGGCCTAATCGGATTACTGGTAAGCTTTT 1347 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1298 TACCTTCGGGGGAATACTAGCTGGCCTAATCGGATTACTGGTAAGCTTTT 1347 1348 TCTTGTTGATAAAAATTCTCGAAATACTACGGAGGCTAGATTGGTGGTGG 1397 |||||||||||||||||||*||||||||**||||||||||*||||||||| 1348 TCTTGTTGATAAAAATTCTAGAAATACTGAGGAGGCTAGACTGGTGGTGG 1397 1398 ATTTCTCTCAGTTCTCCAAAGGGAAAAATGCAATGCGCTTTCCAAGATAC 1447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|| 1398 ATTTCTCTCAGTTCTCCAAAGGGAAAAATGCAATGCGCTTTCCAAGAGAC 1447 1448 TGGAGCCCAAATCTCTCAACATTACGTCGGATCCTGCCCGTGGGGATGCC 1497 |||||||||||*|||||*|||*|||||||||||||||||*|||||||||| 1448 TGGAGCCCAAACCTCTCCACACTACGTCGGATCCTGCCCCTGGGGATGCC 1497 1498 CAGGATTTCTCTGGACTTATCTCAGGCTTTTTATCATCTTCCTCTTAATC 1547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1498 CAGGATTTCTCTGGACTTATCTCAGGCTTTTTATCATCTTCCTCTTAATC 1547 1548 CTGCTAGTAGCAGCAGGCTTGCTGTATCTGACGGACAACATGTCTATTAT 1597 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||**|||||*||| 1548 CTGCTAGTAGCAGCAGGCTTGCTGTATCTGACGGACAACGGGTCTACTAT 1597 1598 TTTAGAAAAGCTCCAATGGGAGTCGGTCTCAGTCCTTTTCTCCTCCATCT 1647 |||||*||||||||||||||*|||||||||||*||||||||||||||||| 1598 TTTAGGAAAGCTCCAATGGGCGTCGGTCTCAGCCCTTTTCTCCTCCATCT 1647 1648 CTTCACTACTGCCCTCGGATCAGAAATCGCTCGTCGCTTTAATGTTTGGA 1697 |*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1648 CCTCACTACTGCCCTCGGATCAGAAATCGCTCGTCGCTTTAATGTTTGGA 1697 1698 CTTTTACTTATATGGATGACTTCCTCCTCTGCCACCCAAACGCTCGTCAC 1747 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1698 CTTTTACTTATATGGATGACTTCCTCCTCTGCCACCCAAACGCTCGTCAC 1747 1748 CTTAACTCAATTAGCCACGCTGTCTGTTCTTTTCTACAAGAATTAGGAAT 1797 ||||||||||||||||||||||||||**|||||||||||||*|||||*|| 1748 CTTAACTCAATTAGCCACGCTGTCTGCACTTTTCTACAAGAGTTAGGGAT 1797 1798 ACGCATAAACTTTGATAAGACTACTCCGTCTCCTGTAAATGACATAAGAT 1847 |||*||*||||||||*||*||||||||*||*|||||*|||||*||*|||| 1798 ACGAATTAACTTTGACAAAACTACTCCATCACCTGTCAATGAGATCAGAT 1847 1848 TCCTCGGTTACCAGATTGATCAGAAATTCATGAAGATCGAAGAAAGCAGA 1897 |||||||||||||*||||||||*||||*||*||||||*|||||||||||| 1848 TCCTCGGTTACCAAATTGATCAAAAATACACGAAGATAGAAGAAAGCAGA 1897 1898 TGGATAGAACTAAGGACTGTTATCAAGAAAATAAAAATAGGTGCATGGTA 1947 ||||**|||*||*|||||||*|||||||||||||||||*||||*|||||| 1898 TGGAGTGAATTACGGACTGTAATCAAGAAAATAAAAATTGGTGAATGGTA 1947 1948 TGACTGGAAATGTATTCAAAGATTTGTTGGGCATTTGAACTTTGTGTTAC 1997 |||*||||||||||||||*|||||||||||||||||*||||||||*|||| 1948 TGATTGGAAATGTATTCAGAGATTTGTTGGGCATTTAAACTTTGTATTAC 1997 1998 CATTTACTAAAGGTAACATTGAAATGTTAAAACCAATGTATGCTGCTATT 2047 |*|||||||||||||**||*||||||||||||||||||||||*||||||* 1998 CGTTTACTAAAGGTAGTATAGAAATGTTAAAACCAATGTATGATGCTATC 2047 2048 ACTAACAAAGTTAACTTTAGCTTCTCTTCAGCTTATAGGACTTTATTGTA 2097 |||*|||||||*|||||||||||||||||*||||||||||||||**|*|| 2048 ACTCACAAAGTAAACTTTAGCTTCTCTTCTGCTTATAGGACTTTGCTATA 2097 2098 CAAATTAACTATGGGTGTTTGTAAATTAGCCATTCGACCAAAGTCCTCTG 2147 ||||||||||||||||||||||||||||*|*|||**|||||||||||||| 2098 CAAATTAACTATGGGTGTTTGTAAATTATCGATTAAACCAAAGTCCTCTG 2147 2148 TACCTTTGCCACGTGTAGCCACAGATGCTACTCCAACACATGGCGCAATA 2197 |||||||||||||||||||||||||||||||*||*||||||||||||||| 2148 TACCTTTGCCACGTGTAGCCACAGATGCTACACCCACACATGGCGCAATA 2197 2198 TCCCATATCACCGGCGGGAGCGCAGTGTTTGCTTTTTCAAAGGTCAGGGA 2247 ||||||||||||||||||||||||||||||*|||||*||||||||||*|| 2198 TCCCATATCACCGGCGGGAGCGCAGTGTTTACTTTTACAAAGGTCAGAGA 2247 2248 TATACATATACAGGAATTGCTGATGGTATGTTTAGCTAAGATAATGATTA 2297 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||| 2248 TATACATATACAGGAATTGCTGATGGTATGTTTAGCTAGGATAATGATTA 2297 2298 AACCCAGATGTATACTCTCCGATTCTACTTTTGTTTGCCACAAACGTTAT 2347 ||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||| 2298 AACCCAGATGTATACTTTCCGATTCTACTTTTGTTTGCCACAAACGTTAT 2347 2348 CAGACGTTACCATGGCATTTTGCTATGTTGGCCAAACAACTGCTATCTCC 2397 ||||||||||||||||||||||||*||*|*|||||||||||||||||||| 2348 CAGACGTTACCATGGCATTTTGCTGTGCTAGCCAAACAACTGCTATCTCC 2397 2398 TATACAGTTGTACTTTGTTCCAAGTAAATACAATCCTGCTGACGGCCCAT 2447 |||||***||||||||||||||||*|||||*||||||||||||||||||| 2398 TATACCAGTGTACTTTGTTCCAAGCAAATATAATCCTGCTGACGGCCCAT 2447 2448 CCAGGCACAGACCGCCTGATTGGACGGCTCTTACATACACCCCTCTCTCG 2497 |||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2448 CCAGGCACAAACCGCCTGATTGGACGGCTCTTACATACACCCCTCTCTCG 2497 2498 AAAGCAATATATATTCCACATAGGCTATGTGGAACTTAAGAATTACACCC 2547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2498 AAAGCAATATATATTCCACATAGGCTATGTGGAACTTAAGAATTACACCC 2547 2548 CTCTCCTTCGGAGCTGCCTGCCAAGGTATCTTTACGTCTACATTGCTGTT 2597 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2548 CTCTCCTTCGGAGCTGCCTGCCAAGGTATCTTTACGTCTACATTGCTGTT 2597 2598 GTCAGCCTTGACTGTACCTTTGGTATGTACCATTGTTTATGATTCTTGCT 2647 |||****||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2598 GTCGTGTTTGACTGTACCTTTGGTATGTACCATTGTTTATGATTCTTGCT 2647 2648 TATATATGGATATCAATGCTTCTAGAGCCTTAGCCAATGTATATGATCTG 2697 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||| 2648 TATATATGGATATCAATGCTTCTAGAGCCTTAGCCAATGTGTATGATCTG 2697 2698 CCAGATGATTTCTTTCCAAAAATTGATGATCTTGTAAGGGATGCTAAAGA 2747 ||*||||||||||||||*||||||||||||||||||||*||||||||||| 2698 CCCGATGATTTCTTTCCTAAAATTGATGATCTTGTAAGAGATGCTAAAGA 2747 2748 CGCTTTAGAACCTTACTGGAAATCTGATTCAATAAAGAAACATGTTTTGA 2797 |||||||||*|||||*||||||||*||*||||||||||||||||||||*| 2748 CGCTTTAGAGCCTTATTGGAAATCAGACTCAATAAAGAAACATGTTTTAA 2797 2798 TTGCAACTCACTTTGTGGATCTTATTGAAGACTTCTGGCAGACTACTCAG 2847 |*||||||||||||||||||||||||||*||*||*|||||||||||*||| 2798 TCGCAACTCACTTTGTGGATCTTATTGAGGATTTTTGGCAGACTACACAG 2847 2848 GGTATGCATGAAATTGCTGAATCCTTAAGAGCAGTAATACCACCTACCAC 2897 ||||||||||||||*||||||*|||||||||||||*||*||*||*||*|| 2848 GGTATGCATGAAATCGCTGAAGCCTTAAGAGCAGTTATTCCTCCAACTAC 2897 2898 TGCTCCTGTACCTACTGGATATCTCATTCAACACGAGGAGGCTGAAGAGA 2947 *||*||*||*||**|*||*|||||*|||||*|||||*||||||||||||| 2898 AGCACCAGTTCCCTCAGGTTATCTTATTCAGCACGAAGAGGCTGAAGAGA 2947 2948 TACCCTTAGGTGATTTATTTAAACATCAGGAAGAAAGAATAGTCAGTTTT 2997 |*||*||*||||||||||||||||||||*||||||||*|||||||||||* 2948 TTCCTTTGGGTGATTTATTTAAACATCAAGAAGAAAGGATAGTCAGTTTC 2997 2998 CAACCAGACTATCCTATTACAGCAAGAATT 3027 ||||||||*||||||||*||*||*|||||| 2998 CAACCAGATTATCCTATCACTGCGAGAATT 3027